Pipeline di analisi RNA-seq pronte all'uso alimentate dagli algoritmi QIAGEN CLC
Compatibile con i kit di preparazione delle librerie più diffusi
Esplorazione e filtraggio facili e intuitivi dei geni differenzialmente espressi in una dashboard interattiva di facile utilizzo
Supporto all'interpretazione attraverso l'annotazione con i principali pathway impattati, upstream
regolatori, malattie e funzioni più impattate, interrogate dalla Knowledge Base di QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA)
Supporto decisionale sugli esperimenti di verifica dei biomarcatori con il prodotto
raccomandazioni e comodi strumenti di progettazione personalizzata nel QIAGEN GeneGlobe Design & Analysis Hub
Dettagli del prodotto
Le soluzioni GeneGlobe Analyze combinano algoritmi e conoscenze leader del settore con la facilità d'uso. Il portale di analisi QIAGEN RNA-seq basato su cloud è accessibile da GeneGlobe Analyze e consente l'analisi dei dati RNA-seq, dall'allineamento delle letture grezze all'interpretazione dei geni differenzialmente espressi e alla ricerca degli strumenti giusti per la verifica di potenziali biomarcatori.
Prestazioni
Il portale di analisi RNA-seq di QIAGEN riduce i tempi di analisi da giorni a poche ore:
analisi dei microRNA: richiede solo 90 minuti dal file fastq all'espressione differenziale (sulla base dei dati di QIAseq miRNA Library Kit, 96 campioni con ~5M di letture per campione, letture single-end da 75 bp)
Analisi dell'intero trascrittoma: richiede solo 4 ore dal file fastq all'espressione differenziale (in base ai dati di QIAseq Stranded RNA Library Kit, 96 campioni, 60M letture per campione, letture paired-end 2 x 75 bp)
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