Tutti i batteri e gli archei contengono una subunità ribosomiale nota come 16S, lunga circa 1.500 nucleotidi e contenente nove regioni ipervariabili (V1-V9) distribuite tra regioni altamente conservate che sono specifiche del genere o della specie. Il sequenziamento del gene dell'RNA ribosomiale (rRNA) 16S, un marcatore genetico consolidato, è il gold standard per l'analisi di campioni batterici per l'identificazione e la classificazione sia di colture pure che di campioni misti. Grazie all'introduzione del sequenziamento di nuova generazione (NGS), il metodo del 16S rRNA è ora ampiamente utilizzato anche per deconvolvere comunità microbiche complesse, come i microbiomi dell'intestino umano.
La regione V1-V9 è in grado di distinguere meglio le specie batteriche rispetto ad altre sottoregioni. EasySeq™ 16S rRNA V1-V6 e V9 Bacterial ID fornisce l'analisi completa delle regioni variabili V1-6 e V9 del gene 16S rRNA batterico. Questo kit supporta una strategia di identificazione batterica guidata dall'NGS per le malattie infettive, le indagini sulla contaminazione e i test di analisi delle cause principali da campioni clinici.
Compatibilità del kit e della piattaforma
Nota bene: il kit EasySeq™ 16S rRNA V1-6 e V9 Bacterial ID NGS Library Prep è progettato per sequenziare le regioni ipervariabili V1-V6 e V9 in una reazione multiplex utilizzando due diversi pannelli di sonde. Richiede due piastre Unique Dual Index per l'uso associato.
Il kit di sequenziamento EasySeq™ 16S rRNA V1-6 e V9 Bacterial ID viene utilizzato con DNA estratto da colture pure e consente anche l'amplificazione diretta di DNA da materiali clinici.
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