Software per sequenziamento NGS Mix²
da laboratoriodi analisi

software per sequenziamento NGS
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Caratteristiche

Applicazioni
per sequenziamento NGS, da laboratorio
Funzione
di analisi

Descrizione

Stime precise della concentrazione dei trascritti Rilevamento accurato dell'espressione differenziale Eccezionale riproducibilità in condizioni variabili Tempi di esecuzione rapidi e memoria ridotta Software di analisi dei dati RNA-Seq Mix² Uno strumento software per la stima accurata della concentrazione di RNA dai dati RNA-Seq. Modello Il bias dei frammenti nell'RNA-Seq rappresenta una seria sfida per la quantificazione accurata delle isoforme geniche. Mix² non fa ipotesi sul bias di copertura, ma adatta ai dati un modello di miscela per ogni isoforma genica (Fig. 1). Mix² può quindi, ad esempio, rappresentare accuratamente il bias 5', come mostrato nella Fig. 1 (a e b), mentre Cufflinks si limita alla distribuzione uniforme (Fig. 1c). Uno strumento software per la stima accurata della concentrazione di RNA dai dati RNA-Seq.

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