Kit di reagenti in soluzione

NGSdi preparazione di banche di RNA

mRNA-Seq inclusa la selezione poly(A) Ampia gamma di input di RNA totale (da 1 ng a 1 μg) Flusso di lavoro facile tutto in uno Dalla selezione poly(A) alle librerie pronte per il sequenziamento in 5,5 ore Identificatori molecolari unici (UMI) inclusi 12 nt Unique Dual Indices (UDI) inclusi Il CORALL mRNA-Seq Library Prep Kit consente la generazione rapida ed economica di librerie a filamento, etichettate UMI e con doppio indice univoco per analisi di RNA poli(A) dell'intero trascrittoma utilizzando le piattaforme Illumina® NGS. Superiore copertura end-to-end La copertura completa di CORALL offre una migliore rappresentazione del sito di inizio e fine della trascrizione. La copertura delle letture è stata analizzata utilizzando i controlli spike-in ERCC, che presentano siti di inizio e fine trascrizione precisi e noti (TSS e TES, rispettivamente). CORALL legge la mappa più accuratamente al TSS esatto ERCC (Fig. 3A) rispetto alle librerie concorrenti, che non riescono a coprire i veri siti di inizio. Inoltre, CORALL fornisce una copertura elevata a TES (Fig. 3B). Analisi dei dati Una pipeline di analisi dei dati è ora disponibile sulla piattaforma BlueBee® Genomics. La pipeline fornita consente agli utenti del kit di eseguire il controllo di qualità della lettura, la mappatura, la deduplicazione dell'identificatore molecolare unico (UMI) e la quantificazione dei trascritti. Per utilizzare il tuo codice di attivazione registra un account con BlueBee (https://lexogen.bluebee.com/portal) e carica i tuoi dati (file fastq.gz). NOTA: BlueBee Data Analysis è disponibile per una serie di specie, fare riferimento alla FAQ 7. I genomi di riferimento per nuove specie possono essere aggiunti su richiesta. Si prega di notare che questo comporta una tassa. Vedi CORALL Data Analysis, per ulteriori dettagli.