All'interno del sistema di gestione dei rifiuti, l'aria entra nell'apertura di lavoro dell'unità e passa sopra le porte di smaltimento, catturando il particolato generato dallo svuotamento delle gabbie. L'aria viene quindi convogliata attraverso un sistema di pre-filtro a due stadi, passa attraverso il filtro HEPA del terzo stadio (efficienza del 99,99% fino a 0,3 micron di particelle) e ritorna nella stanza alla base posteriore dell'unità. Le lettiere e gli scarti animali passano attraverso le porte a imbuto dove vengono incanalati in doppie buste di plastica rivestite o in scatole di combustione rivestite in polivinile. I sacchetti o le scatole possono essere sigillati nell'unità prima di essere rimossi dal sistema.
L'accesso è previsto all'interno del cofano per sigillare i contenitori prima dello smontaggio. Questa funzione consente di ridurre l'esposizione del personale agli allergeni.
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