l'intero genoma delle principali razze bovine, consentendo applicazioni quali la selezione abilitata a livello di genoma, l'identificazione di loci di tratti quantitativi, la valutazione del merito genetico degli individui e gli studi di genetica comparativa.
Questo BeadChip è stato sviluppato da Illumina in collaborazione con l'USDA-ARS, l'Università del Missouri e l'Università di Alberta. Oltre 22.000 sonde SNP mirano a nuovi loci SNP scoperti dal sequenziamento Illumina di 3 popolazioni di bovini da carne e da latte di importanza economica.
Il contenuto aggiuntivo deriva da fonti pubblicamente disponibili, come il genoma di riferimento dei bovini, Btau, e il set di dati del Bovine HapMap Consortium. Tutte le sonde SNP sono state validate in 18 razze bovine e da latte comuni. Questo prodotto si rivolge a SNP uniformemente distribuiti che sono polimorfici in tutte le razze testate e fornisce una spaziatura mediana di 37,4 kb.
Questo BeadChip a 24 campioni rappresenta una soluzione di genotipizzazione ad alta densità per la caratterizzazione del genoma nei bovini da latte e da carne
La preparazione del campione senza PCR e in singola provetta1,2 riduce significativamente la manodopera e i potenziali errori di manipolazione del campione
Un sistema di gestione delle informazioni di laboratorio basato su array e l'automazione robotica sono disponibili per tracciare in modo accurato ed efficiente i campioni durante l'analisi
Per uno screening genetico ad alto rendimento ed economico, l'array BovineSNP50 BeadChip presenta più di 53.000 sonde SNP uniformemente spaziate che coprono il genoma bovino. Per una maggiore flessibilità, la versione BovineSNP50+ del BeadChip può essere personalizzata per includere fino a 600.000 marcatori aggiuntivi.
Specifiche tecniche
Tipo di test - Infinium HTS
Capacità di automazione - Caricatore automatico di array, robot di manipolazione dei liquidi
---