Informazioni sul sequenziamento metagenomico di prossima generazione
l'intero processo mNGS include procedure di laboratorio umido e procedure di laboratorio a secco, le procedure di laboratorio umido includono: pre-trattamento del campione, estrazione dell'acido nucleico, preparazione della libreria, quantificazione della libreria, sequenziamento. I diversi reagenti saranno necessari per le procedure.
Le procedure del laboratorio a secco includono il controllo di qualità dei dati di sequenziamento, il confronto e l'analisi ecc.
Attraverso anni di ricerca e sviluppo, MatriDx ha lanciato i kit di reagenti per la deplezione dell'ospite, i kit di preparazione della libreria di DNA/RNA e il kit di quantificazione della libreria NGS.
Kit di reagenti per la deplezione dell'ospite
Applicazione
Questo kit è utilizzato per impoverire il DNA dell'ospite dai campioni (inclusi BALF, idrotorace e ascite, CSF, espettorato, ecc.), è stato verificato che questo kit può efficacemente arricchire batteri, funghi, virus del DNA, clamidia e micoplasma nei campioni clinici, può migliorare notevolmente la sensibilità di rilevamento di mNGS.
Vantaggi
Basso tempo: consumo: il tempo totale è di circa 15 minuti (circa 2-4 ore per altri metodi)
Alta efficienza: La proporzione di sequenze microbiche totali è aumentata in media di 29,4 volte.
Vantaggi
1. Aumento del tasso di rilevamento, riduzione del tasso di falsi negativi.
2. Aumentato l'RPM, aumentare la credibilità dell'identificazione.
3. Può identificare le specie e persino le sottospecie.
Kit di preparazione della biblioteca di DNA/RNA
Applicazione
Questo kit è utilizzato per l'estrazione dell'acido nucleico e la preparazione della libreria per i sequenziatori illumina, include l'estrazione del DNA/RNA, la trascrizione inversa dell'RNA, la frammentazione del DNA/cDNA, la riparazione dell'estremità A tailing, la legatura dell'adattatore, la purificazione della libreria.
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