Kit di test per biologia cellulare C01080002

di celluleper sequenziamento

L'ATAC-seq, Assay for Transposase-Accessible Chromatin, seguito da sequenziamento di nuova generazione, è una tecnologia chiave per la mappatura a livello genomico della cromatina accessibile. La tecnologia si basa sull'uso della trasposasi Tn5 che taglia la cromatina esposta e aperta e contemporaneamente lega gli adattatori per la successiva amplificazione e sequenziamento. I metodi ATAC-seq consentono di: Acquisire informazioni sulla regolazione genica e comprendere le firme della cromatina aperta Determinare le posizioni dei nucleosomi con una risoluzione di un singolo nucleotide Scoprire l'occupazione di fattori di trascrizione (TF) Il kit ATAC-seq di Diagenode si basa su un protocollo altamente validato e ottimizzato per 50.000 cellule per reazione. Il kit comprende i reagenti per la lisi cellulare e l'estrazione dei nuclei, la tagmentazione e la purificazione del DNA, nonché per l'amplificazione della libreria. Gli indici dei primer per il multiplexing non sono inclusi nel kit e devono essere acquistati separatamente. Caratteristiche del kit ATAC-seq: Fabbisogno di cellule: 50.000 cellule / rxn Protocollo robusto con elevata riproducibilità tra repliche ed esperimenti ripetitivi Cattura del DNA facile ed efficiente dopo la reazione di tagmentazione utilizzando le colonne MicroChIP DiaPure di Diagenode (incluse) Fase aggiuntiva di qPCR per determinare il numero di cicli necessari per l'amplificazione della libreria: Evita la sovraamplificazione Consente l'adattamento/flessibilità per i campioni più impegnativi per avere successo con la preparazione delle librerie. Fornisce un'indicazione precoce se l'esperimento non funziona (nessuna amplificazione qPCR)