CleanDTR è un efficiente sistema basato su microsfere paramagnetiche, progettato da CleanNA per rimuovere i terminatori di colorante non incorporati dalle reazioni di sequenziamento Sanger. Può essere utilizzato anche per CRISPR-Cas9. Il processo CleanDTR prevede tre semplici fasi: legare, lavare ed eluire. Mentre il prodotto di sequenziamento si lega selettivamente alle particelle magnetiche, i coloranti, i nucleotidi, i sali e i primer non incorporati vengono rimossi durante i lavaggi con etanolo. Questo principio consente l'eluizione del prodotto di sequenziamento Sanger puro nel tampone di eluizione prescelto. Il protocollo può essere adattato alla vostra attuale stazione di lavoro per la manipolazione dei liquidi (ad es. Beckman, Hamilton, Tecan, Caliper, Perkin Elmer, Agilent ed Eppendorf) utilizzando il vostro protocollo attuale così come può essere eseguito manualmente.
Vantaggi
Lunghezze di lettura Phred 20 con una media di oltre 800 bps
Tassi di passaggio superiori all'85% o più
Eliminazione efficiente dei contaminanti della reazione di sequenziamento
Riduzione dell'utilizzo di BigDye*, grazie all'aumento della potenza media del segnale
Applicazioni
Pulizia del prodotto di sequenziamento per
Piattaforme ABI e MegaBACE
Chimiche supportate
- BigDye* versioni 1.0, 1.1, 2.0, 3.0 e 3.1
- DYEnamic ET
* BigDye è un marchio registrato di Applied Biosystems
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