Software per biologia molecolare

di analisidi visualizzazioneWindows

Una tela visiva completamente nuova per esplorare i dati di una singola cellula La vostra roadmap per l'analisi dei dati monocellulari I nostri strumenti software semplificano l'elaborazione, la visualizzazione e l'esplorazione dei dati di cellule singole, anche senza l'aiuto della bioinformatica. Pipeline di analisi Cell Ranger Trasformare le sequenze grezze in informazioni sulle singole cellule Cell Ranger è una serie di pipeline di analisi gratuite per l'elaborazione dei dati di Chromium Single Cell. Inizia con Cell Ranger per allineare le letture, generare matrici di caratteristiche cellulari, eseguire clustering e analisi secondarie Cell Ranger può elaborare i dati di sequenziamento grezzi, eseguire il controllo qualità, identificare i codici a barre delle cellule e quantificare i livelli di espressione genica a livello di singola cellula. Accelerate i tempi di ottenimento dei risultati con Cloud Analysis, un'applicazione web per l'esecuzione di Cell Ranger Accedete a Cell Ranger dal vostro browser web con Cloud Analysis. Disponibile negli Stati Uniti e in Canada. Browser Loupe 10 modi per scavare nei dati con Loupe Browser Loupe Browser è un'applicazione desktop per Windows e MacOS che consente di visualizzare i dati in modo interattivo. 1Utilizzare Loupe per approfondire l'analisi di Seurat, senza bisogno di codice LoupeR è un pacchetto R che crea un file Loupe Browser da un oggetto Seurat. Con LoupeR è possibile esplorare i dati Seurat in Loupe senza dover ricorrere alla riga di comando. 2Trovare i geni espressi in modo differenziato negli esperimenti di trattamento rispetto a quelli di controllo Eseguite e iterate facilmente confronti multi-campione. 3Visualizzare rapidamente l'espressione dei geni preferiti 4Creare rapidamente un grafico dei risultati dell'espressione differenziale Esplorate mappe di calore interattive e grafici a violino dei geni espressi in modo differenziato. 5Annota facilmente i tipi di cellule